Engenharia genética/Preparação das Taq e Pfu DNA polimerases de Escherichia coli recombinante: diferenças entre revisões
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[[Engenharia Genética:Amplificação por PCR do gene GFP de Aequorea victoria|Amplificação por PCR do gene GFP de ''Aequorea victoria'']]
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[[Imagem:E coli at 10000x.jpg|thumb|
[[Imagem:E coli.jpg|thumb|right|400px|Micrografia electrónica de bactérias ''Escherichia coli''.]]
▲[[Imagem:E coli at 10000x.jpg|thumb|left|500px|Micrografia electrónica a baixa temperatura de um agregado de bactérias ''E. coli'' (amplificação: 10000X).]]
[[Imagem:Plasmid_replication_(english).svg|thumb|right|400px|Comparação da actividade de plasmídeos não-integrativos (acima da linha) com epissomas (abaixo da linha), durante a divisão celular. Na primeira situação, está representada uma bactéria com o seu DNA cromossómico e plasmídeos dividindo-de em duas bactérias idênticas, cada uma com o seu DNA cromossómico e plasmídeos. Na primeira situação, está representada uma bactéria com o seu DNA cromossómico, mas com um epissoma. A seguir, observa-se a mesma bactéria após integração do epissoma no DNA cromossómico. Esta bactéria divide-se em duas bactérias idênticas, cada uma com o epissoma integrado no seu genoma.]]
▲=== Dia 1 ===
▲# Inocular 4 mL de [http://en.wikipedia.org/wiki/LB_medium meio LB] amp com ''Escherichia coli'' BL21(DE3) pET-Pfu e pET-Taq;
▲# [http://en.wikipedia.org/wiki/Incubator_%28microbiology%29 Incubar] a 37 ºC, com agitação.
* Inocular 200 mL de ''SuperBroth'' com 0.4 mL da cultura anterior e incubar a 37ºC, com agitação;
▲=== Dia 2 ===
▲# Quando a [http://en.wikipedia.org/wiki/Optical_density Densidade Óptica] (λ=600nm) ≈0.4, adicionar 0.4 mL [http://en.wikipedia.org/wiki/IPTG IPTG] 1M (concentração final = 2 mM);
▲=== Dia 3 ===
* Eliminar o sobrenadante e ressuspender o [http://en.wikipedia.org/wiki/Pellet ''pellet''] em 5 mL de tampão A;
▲# Dividir a cultura em duas partes de 25 mL e distribuir em tubos Falcon de 50 mL;
▲# Centrifugar (5000 rpm, 10 minutos, 4ºC);
▲# Incubar à temperatura ambiente, durante 15 minutos;
▲# No gelo, guardar ≈0.1 mL da solução num tubo ''eppendorf'', previamente marcado como '''Amostra 1''';
* Transferir o máximo possível de sobrenadante para alguns tubos ''eppendorf'';
▲# Incubar a 75 ºC, durante 60 minutos, num banho de água com agitação;
▲# Centrifugar (15300 rpm, 20 minutos, 4ºC);
▲# No gelo, guardar 0.1 mL da solução num tubo ''eppendorf'', previamente marcado como '''Amostra 2''';
▲# Misturar com igual volume (≈4 mL) tampão ''Storage'' com 50 % de glicerol;
▲# Misturar com igual volume (≈8 mL) tampão ''Storage'' com 75 % de glicerol;
▲# O lisado está agora diluído 4 vezes e, cada grupo de trabalho, deverá ter ≈8 mL de solução;
▲# Marcar o tubo que contém o lisado e guardar a -20 ºC (para usar na próxima etapa).
== Soluções ==
* '''''Superbroth''''': (32 g triptona + 20 g extracto de levedura + 5 g NaCl + 1,25 mL 4N NaOH) / litro.
▲ '''Tampão A''': 50 mM Tris-HCl (pH 7.9) + 50 mM dextrose + 1 mM EDTA
▲ '''Tampão B''': 10 mM Tris-HCl (pH 7.9) + 50 mM KCl + 1 mM EDTA + 0.5% Tween 20 (1%) + 1 mM PMSF
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